Das Bodensee-Naturmuseum zeigt als "Fenster zum See" dessen einzigartige Landschaft. Besonders sehenswert ist der Blick auf See und Alpen aus dem großen Panoramafenster. Die Entstehung des Bodensees und seine vielfältigen Lebensräume bilden mit liebevoll ausgestellten Tieren und informativen Modellen das Kernstück der anschaulichen Ausstellung. Vieles ist zum Mitmachen und Anfassen konzipiert: beispielsweise die Streicheltiere Wildschwein und Dachs, das Quakophon zum Anhören von Froschrufen oder die Mikroskope, unter denen die kleinsten Bewohner des Bodensees zu entdecken sind.

Dazu gibt es Wissenswertes über die Eiszeiten am Bodensee und eine Ausstellung zur Gewässerökologie. Das bodensee-web bietet Internet-Zugang für weitere Infos rund um die Gewässerkunde. Hinzu kommen wechselnde Sonderausstellungen und das frei zugängliche Spiel- und Lerngelände "steine im fluss" vor dem Museum. Das Bodensee-Naturmuseum ist familien- und behindertengerecht eingerichtet und nur wenige Gehminuten von Bus und Bahn entfernt.

Das Naturmuseum befindet sich im Gebäude es Sea Life-Centers.